Для защиты своих прав каждый осужденный может обратиться как в УФСИН России по Вологодской области, осуществляющий ведомственный контроль за деятельностью сотрудников колоний, так и в органы прокуратуры. С целью осуществления контроля за соблюдением прав осужденных в местах лишения свободы исправительные учреждения области регулярно посещают представители Общественной наблюдательной комиссии Вологодской области. Только за 2013 год представители общественности полсотни раз выезжали в вологодские колонии. Ежемесячно посещает исправительные учреждения региона Уполномоченный по правам человека в Вологодской области. Все проверяющие отмечают удовлетворительные результаты деятельности УФСИН по укреплению правопорядка и законности в учреждениях, обеспечению условий содержания осужденных и лиц, содержащихся под стражей, соблюдения их прав.
За последнее время, с началом реформирования уголовно-исполнительной системы в 2010 году, в исправительных учреждениях области проведены большие преобразования. Строятся новые корпуса для содержания осужденных, а в имеющихся сооружениях осуществляются капитальные ремонты. В исправительных колониях особого режима № 4 и № 5 завершается строительство новых корпусов в соответствии с европейскими нормами. Практически заново построена столовая в колонии-поселении № 7. Проводится систематическая работа по совершенствованию социальной, психологической и воспитательной работы с осужденными, укреплению дисциплины. По итогам минувшего года уровень нарушений установленного порядка отбывания наказания среди осужденных заметно снизился. В настоящее время в служебной деятельности сотрудников колоний используются видеорегистраторы, которые позволяют фиксировать взаимоотношения персонала и осужденных, совершение ими правонарушений. Данные видеорегистраторов позволяют получить объективную оценку действий сотрудников колоний при рассмотрении жалоб осужденных.